Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Vpreb1P13372 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms