Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Spta1P08032 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Spta1P08032 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Spta1P08032 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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