Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
AurkcO88445 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms