Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp4O70480 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp4O70480 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms