Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Atf6bO35451 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Atf6bO35451 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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