Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Abcc1O35379 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcc1O35379 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Abcc1O35379 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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