Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp35M0QWN7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp35M0QWN7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp35M0QWN7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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