Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm2035J3QP87 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms