Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim18J3QNP2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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