Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3415J3QMS8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3415J3QMS8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm3415J3QMS8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3415J3QMS8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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