Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nccrp1G3X9C2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms