Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp32F8VPZ3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp32F8VPZ3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms