Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
H2-M1F7CXU4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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H2-M1F7CXU4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
H2-M1F7CXU4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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