Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
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Gm28048F7BCN0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm28048F7BCN0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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