Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm5861F6VCN9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms