Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ryr1E9PZQ0 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ntf3-203ENSMUST00000204542 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms