Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Brd1E9PZ26 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Brd1E9PZ26 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms