Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rsph10bE9PYQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms