Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms