Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trabd2bB1ATG9 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms