Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Odf2A3KGV1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms