Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp8b5A3FIN4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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