Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
H2al1jA2BFR3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms