Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cldn34dA2AGU5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms