Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc163A2AGD7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms