Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcn5Q9WVD4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clcn5Q9WVD4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clcn5Q9WVD4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clcn5Q9WVD4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms