Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trpc2Q9R244 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trpc2Q9R244 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpc2Q9R244 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms