Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cnot9Q9JKY0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cnot9Q9JKY0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cnot9Q9JKY0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms