Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh2b2Q9JID9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sh2b2Q9JID9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sh2b2Q9JID9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2b2Q9JID9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2b2Q9JID9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2b2Q9JID9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2b2Q9JID9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sh2b2Q9JID9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms