Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tfcp2Q9ERA0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tfcp2Q9ERA0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tfcp2Q9ERA0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tfcp2Q9ERA0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms