Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
March8Q9DBD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March8Q9DBD2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
March8Q9DBD2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms