Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Borcs8Q9D6Y4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Borcs8Q9D6Y4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Borcs8Q9D6Y4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Borcs8Q9D6Y4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms