Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4933425L06RikQ9D3Z8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms