Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sec13Q9D1M0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sec13Q9D1M0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sec13Q9D1M0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms