Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc167Q9D162 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc167Q9D162 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc167Q9D162 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms