Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd4Q9CWX4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd4Q9CWX4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms