Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BccipQ9CWI3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BccipQ9CWI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BccipQ9CWI3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BccipQ9CWI3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms