Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp5sQ9CRA7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp5sQ9CRA7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp5sQ9CRA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms