Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Map1lc3bQ9CQV6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Map1lc3bQ9CQV6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Map1lc3bQ9CQV6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms