Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nus1Q99LJ8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nus1Q99LJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nus1Q99LJ8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms