Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TrabdQ99JY4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TrabdQ99JY4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrabdQ99JY4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrabdQ99JY4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms