Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd6Q99JI4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms