Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Apobec3Q99J72 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Apobec3Q99J72 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms