Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rnf144aQ925F3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rnf144aQ925F3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf144aQ925F3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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