Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trub2Q91WG3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Trub2Q91WG3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trub2Q91WG3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trub2Q91WG3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms