Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rufy2Q8R4C2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rufy2Q8R4C2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rufy2Q8R4C2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms