Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Treml1Q8K558 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Treml1Q8K558 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Treml1Q8K558 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms