Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Polr1eQ8K202 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Polr1eQ8K202 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Polr1eQ8K202 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms