Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CopaQ8CIE6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CopaQ8CIE6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CopaQ8CIE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms