Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc178Q8CDV0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc178Q8CDV0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc178Q8CDV0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms